Ранее частью 5 статьи 2 Федерального закона «Об автономных учреждениях» предусматривалось, что собственник имущества автономного учреждения не несет ответственность по обязательствам автономного учреждения.
Вместе с тем, в пункте 6 статьи 123.22 ГК РФ закреплено, что по обязательствам автономного учреждения, связанным с причинением вреда гражданам, при недостаточности имущества учреждения, на которое может быть обращено взыскание, субсидиарную ответственность несет собственник имущества автономного учреждения.
В целях устранения существующих противоречий новой редакцией части 5 статьи 2 Федерального закона «Об автономных учреждениях» установлено, что собственник имущества автономного учреждения несет субсидиарную ответственность по обязательствам автономного учреждения в случаях, предусмотренных Гражданским кодексом РФ.